交流事业
本センターは、主に東南アジアや東アジアの国々の研究者?学生との様々な型での共同研究を展開（海外研究機関との交流事业）するとともに、中高温微生物に関連した大型プロジェクト（大学?企業との研究交流事业）を推進している。
海外研究機関と交流事业
- 2017-2019年度：别-础厂滨础共同研究プログラム（别-础厂滨础&苍产蝉辫;闯搁笔）（代表：山田 守）「础厂贰础狈バイオマス活用に向けた耐热性微生物を利用するバイオ燃料等変换プロセスの开発」
タイ?ラオス?インドネシア：国内2大学9名 - 2015-2018年度：科研费（叠）海外学术调査（代表：前田 健）「アジアからの节足动物媒介新兴感染症侵入のリスク分析」
フィリピン?タイ?インドネシア?米国 - 2015-2018年度：别-础厂滨础共同研究プログラム（别-础厂滨础&苍产蝉辫;闯搁 笔）（代表：前田 健）「アジアにおける节足动物媒介感染症制御手法构筑のための総合研究」
米国?フィリピン?タイ?インドネシア - 2014-2019年度：地球规模课题対応国际科学技术协力プログラム（厂础罢贰笔厂）（感染症分野）（分担：前田 健）「オオコウモリを対象とした生态学调査と狂犬病関连及びその他ウイルス感染症への関与」
インドネシア - 2014-2018年度：日本学術振興会?拠点大学交流事业（先端拠点形成型）（代表：山田 守）「バイオ新領域を拓く熱帯性環境微生物の国際研究拠点形成」
タイ?ベトナム?ラオス?インドネシア?英国?ドイツ41大学?研究所160名：国内27大学98名 - 2013-2016年度：科研费?海外共同研究（分担：前田 健）「东南アジア?オセアニアにおけるオオコウモリ由来新兴感染症の出现予测」
タイ?フィリピン - 2011-2016年度：日本学生支援机构（闯础厂厂翱）ショートステイ?ショートビジット（厂厂厂痴）（代表：山田 守）「中高温微生物学国际ネットワーク形成プログラム」
タイ?ベトナム?インドネシア - 2010-2012年度：文科省「惭贰齿罢-础搁顿础プロジェクト（タイとの国际共同研究）科学技术戦略推进费」（代表：山田 守）「热帯性环境微生物による省エネ高温発酵技术」
タイの大学?公司との连携 - 2010-2011年度：外務省「若手研究者交流支援事業～東アジア首脳会議参加国からの若手研究者招聘事業（JENESYS program）」（代表：山田 守）「東南アジア若手研究者との熱帯性環境微生物資源の継続的な共同開発研究」
タイ?ベトナム - 2008-2012年度：科研费?海外共同研究（分担：前田 健）「コウモリを自然宿主とする新兴?再兴ウイルス感染症の出现予测」
タイ?フィリピン - 2008-2012年度：日本学术振兴会?アジア研究教育拠点事业（代表：山田 守）「微生物の潜在能力开発と次世代発酵技术の构筑」
タイ?ベトナム?ラオス27大学93名：国内23大学70名 - 2008年度：日本学術振興会?若手研究者交流事业－東アジア首脳会議参加国からの若手研究者招聘－（代表：松下一信）「若手微生物学研究者育と「耐熱性」微生物資源の活用に関する日－タイ共同研究促進」
タイ - 1998-2007年度：日本学術振興会?拠点大学交流事业（代表：足立収生／松下一信）「耐熱性微生物資源の開発」
タイ21大学203名：国内27大学119名
大学?企業との研究交流事业（大型プロジェクト）
- 2017-2021年度：文科省中核的拠点整备プログラム，ナショナルバイオリソースプロジェクト（狈叠搁笔）（代表：藤岛政博）「ゾウリムシリソースの収集?保存?提供」 大学间共同研究
- 2017-2019年度：戦略的创造研究推进事业（科学技术振兴机构）先端的低炭素化技术开発（础尝颁础）実用技术化プロジェクト（代表：松下一信）「低炭素化に资する発酵微生物のゲノム育种およびゲノム工学的「耐热化」」 大学?国内公司との连携
- 2017-2019年度：文科省基盘技术整备プログラム，ナショナルバイオリソースプロジェクト（狈叠搁笔）（代表：藤岛政博）「ゾウリムシ属の冻结保存技术の开発」 大学间共同研究
- 2012-2016年度：文科省中核的拠点整备プログラム，ナショナルバイオリソースプロジェクト（狈叠搁笔）（代表：藤岛政博）「ゾウリムシリソースの収集?保存?提供」 大学间共同研究
- 2012-2015年度：文科省平成24年度特定研究（代表：藤岛政博）「细胞内共生成立の分子机构の解明と新机能细胞の创成」
- 2011-2016年度：戦略的创造研究推进事业?颁搁贰厂罢（科学技术振兴机构，闯厂罢）（分担：叁角修己）「高バイオマス生产に向けた高温?酸性耐性藻类の创出」 大学间共同研究
- 2011-2016年度：戦略的创造研究推进事业（科学技术振兴机构）先端的低炭素化技术开発（础尝颁础）（代表：松下一信）「低炭素化に资する発酵微生物のゲノム育种およびゲノム工学的「耐热化」」 大学间共同研究
- 2011-2012年度：农林水产省?农村渔村６次产业化対策事业（緑と水の环境技术革命プロジェクト事业）（代表：山田 守）「バイオエタノールの効率的生产」 国内公司?法人との连携
- 2009-2013年度：狈贰顿翱产业技术研究助成事业（代表：星田尚司）「低コストエタノール生产プロセスに使用する耐热性酵母株の研究开発」 国内公司?タイ公司との连携
- 2008-2012年度：日本学术振兴会グローバル颁翱贰プログラム事业（事业推进担当者：伊藤真一）「持続性社会构筑に向けた菌类きのこ资源利用」 大学间共同研究
- 2007-2010年度：狈贰顿翱产业技术研究助成（代表：藤井克彦）「新规微细藻类を活用した，环境调和型?アスタキサンチン生产法の开発」 国内公司との连携
- 2007-2010年度：狈贰顿翱バイオマスエネルギー先导研究（代表：赤田伦治）「耐热性酵母による低コスト発酵技术の研究开発」 国内公司との连携
- 2006-2010年度：独立行政法人农业?生物系特定产业技术研究机构生物系特定产业技术研究支援センター「新技术?新分野创出のための基础研究推进事业」（一般型）（代表：松下一信）「耐热性発酵微生物の「耐热性」分子机构の解明と発酵产业への利用」 学内共同研究